Сборники тезисов • Информационные и интеллектуальные системы и технологии • Технологии программирования, искусственный интеллект, биоинформатика
Сборник тезисов докладов конгресса молодых ученых. Электронное издание. – СПб: Университет ИТМО, 2016.
Разработка функции ранжирования с учетом частот генов на основе гипергеометрического распределения для систем поиска фенотипов
УДК: 004.023
Аннотация:
Количественный анализ экспрессии генов стремительно развивается последние двадцать лет, став стандартным инструментом в молекулярной биологии. Одним из типичных подходов к анализу данных генетической экспрессии является анализ наборов генов. Подавляющее большинство существующих методов основано на сравнении полученного исследователем набора генов, со специально отобранными «эталонными» наборами, используя различные статистические тесты. Одним из таких тестов является точный тест Фишера. Его недостатком является нечувствительность к частоте гена, что приводит к большому количеству нерелевантных результатов при поиске. Целью данной работы является устранение этого недостатка.